המקור לתורת הגאונים הוא משולש : א . ציטטות בדברי הראשונים , אשכנזים וספרדים ; ב . קבצי שאלות ותשובות בכתבי יד מערביים ( אשכנזים , ספרדים ואיטלקים ) - חלק מקבצים אלו נדפסו החל מן המאה השש עשרה ועד היום . לעתים בדפוסים הראשונים נעלם מאיתנו מקורם וכל שנותר בידינו הוא מהדורת הדפוס ומקבילות חלקיות בכתבי יד ; ג . גניזת קהיר שהעשירה את ידיעותינו אלף מונים . את תשובת נטרונאי גאון , או שרידיה , אנו מוצאים בכל אחד ממקורות אלו . לתשובה זו שתי גרסאות מרכזיות שעל פרטיהן נעמוד בהמשך ( להלן : נוסח א' ונוסח ב , ( ' ונמנה אותן כעת על פי סדר כרונולוגי . נוסח א' של תשובת רב נטרונאי גאון מופיע לראשונה , ללא הייחוס לנטרונאי גאון , בספר הפרדס מבית מדרשו של רש"י . התשובה מופיעה כחלק מרצף תשובות העוסקות במומרים ובכוהנים . רצף שאלות זה מופיע , בשמו של נטרונאי גאון , בכתב יד מן המאה הארבע עשרה או החמש עשרה , שקיבץ חומר גאוני רב והועתק על ידי סופר ספרדי ( להלן : כת"י קיימברידג' , ( 474 וכן בכתב יד ספרדי אחר ממנו הדפיס . 2 י' ברודי , תשובותדנ w arc נד הילאי גאו , ; שני כרכים , ירושלים תשנ"ד ולהלן : ברו די , תשומת...
אל הספר